没想到袁今夏身上的毒会比常人扩散的快，林菱告诉她可能会就不回来，袁今夏写下书信走了，众人才知道袁今夏做药引之事。
陆绎在一处破庙内找到袁今夏，林菱没有一成把握救袁今夏，只能死马当活马医，但最终给救回来了，不料倭寇紧追不舍，追到枫林坳，击退倭寇时，杨岳跟上官曦掉入悬崖，之后众人离开，回去寻找帮手。
两人找到后，袁令夏跟着陆绎去了丹青阁，将元明大师押送回京，没想到当天死了一名方士，袁今夏请林菱跟大叔前来帮忙，当晚死了一名新来的方士，谢霄发现袁今夏对陆绎动情便跟袁今夏挑明，袁今夏说他对上官曦的事情没解决完，谢霄给上官曦写了一封退婚书。
经过陆绎的一番推测是元明大师有问题，但遭遇元明大师暗算，短暂失忆，慢慢的陆绎心智开始退化，服用林菱的要之后，好了，陆绎发现元明大师有一处密室，果然有阴谋，陆绎将恢复的事情给跟袁今夏一人讲，其他人选择隐瞒。
最终证实元明大师有问题，将元明大师缉拿，发现其所练丹的方子是药王谷失踪已久的方子，查到给皇上下毒的人是谁，可最后在关键时刻死了，元明大师现场死了，此事完结，陆绎带着袁今夏和谢霄去了杭州，袁今夏救了陆绎的表妹，当时袁今夏男装，表妹对她一见倾心，几人来到表妹家的马场，袁今夏试图收服一匹烈马而受伤，陆绎发觉自家表妹喜欢上袁今夏，内心不开心，袁今夏向表妹说出自己是女儿身，之后表妹加以报复她。
众人参加七夕大赛，上官曦和杨岳被董金峰抓住，董金峰逃跑，后来他救上官曦，坠崖，表弟被害，表妹被迫嫁给盐商，陆绎出意帮助表妹逃跑，表妹没有听从陆绎的安排，设计陷害袁今夏，让她嫁过去，陆绎抢亲，陆绎告白，两人倾心相许，事后表妹家被杀只留表妹遇害，杨岳因为坠崖毁容。
陆绎被吴守绪邀请，不料发现他跟倭寇有交易，两人好不容易脱身，吴守绪又派人送东西，送去了两个女人袁今夏吃错，林菱去药铺抓药，被人拐走，陆绎，袁今夏找人，找人途中袁今夏受伤，被陆绎照顾杨万程看出两人之间猫腻，提醒袁今夏离陆绎远点，门不当户不对，为了消除袁今夏心中疑问，陆绎对她发誓，事后奔赴战场送粮，袁今夏对他日日思念，没想到遭表妹暗杀，没有成功。
杨岳带着受伤的杨万程回来，袁今夏抓药的时候发现了倭寇的踪迹，一路追踪，发现家里藏有火器是，顺着这条线索，接走倭寇的妻儿，逼迫倭寇说出她们的计划，得知她们要攻扬州城，袁今夏等人前去守城，倭寇来犯，袁今夏一行人拼命守城，坚持援军到来得以胜利，报住扬州城，袁今夏唱了一首童谣引起林菱的注意，怀疑袁今夏是姐姐的遗孤，再加上一些相似的地方，让林菱更加深信，找杨万程查证，证实林菱的猜想正确，袁今夏一行人回京，为了免除于将军的罪，陆绎带一只白鹿回京，林菱也跟着一起进京，林菱住在袁今夏家里住着。
袁母让袁今夏相亲，偶遇陆绎，过了几日，陆绎到袁今夏家提亲，与此同时陆绎对袁今夏的身世都点眉目，而林菱已经证实袁今夏是她姐姐的孩子，便去质问杨万程，杨程万也承认袁今夏的身世，袁今夏知道当初夏家被炒家，自己是夏家唯一的血脉，与此同时陆绎得知袁今夏的身世，见袁今夏得知自己身世决定为了不伤害袁今夏，不跟她在一起。
陆绎对袁今夏的态度冷淡，袁今夏喝醉酒，林菱又被拐走，袁今夏趁机混进严府，在快要被杀的时候，陆绎救了袁今夏。袁今夏跟丐叔再次混入严加救林菱，结果自己被擒，陆绎得知消息去救袁今夏，在严家，严世蕃告诉袁今夏当年夏家的灭门的那封弹劾信是陆廷逼人写的，袁今夏不相信。
陆绎最后救出袁今夏，她慢慢恢复，弄清事情真相。严世蕃说的都是事实，正巧陆绎来了，林菱要杀陆绎，袁今夏拼命阻挡，两人之后形同陌路，陆廷找到袁今夏，怀着一份愧疚的心将替夏家洗刷冤屈的证据给了袁今夏，第二天陆廷去世，袁今夏原谅陆家。
蓝青玄被人诬陷身在牢中，袁今夏去抓诬陷的小太监，小太监被抓住，此时严家被人弹劾，命三法司查严世蕃贪墨之事，严世蕃让三法司的人坐在六扇门吃饭，设下鸿门宴，袁今夏躲在房中疑之窥探。之后严世蕃种种罪行查证出来，皇上对严家失去信任，下令立斩严世蕃。
陆绎在大宴之上拿出昭雪书为夏家洗刷冤屈，皇上打怒，将陆绎打入大牢秋后处决，袁今夏一夜白发，在她努力下，皇上不杀陆绎，将他终身监禁，她天天在诏狱跟锦衣卫斗智斗勇，皇上念及旧情放了陆绎，两人最终在一起。
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